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1949年5月19日，台灣省警備總司令部發佈戒嚴令，同年6月蔣介石潰退到台灣。該戒嚴令則維持到1987年7月15日為止，總共長達38年。然而中國國民黨至今依然宣稱，其獨裁恐怖統治時期是「民主陣容」的一環。

戒嚴期間，立法院為了防止中國共產黨在台灣擴散並鞏固當權者統治地位，通過了《懲治叛亂條例》以及《動員戡亂時期檢肅匪諜條例》，擴充了解釋犯罪的構成要件，縱容情治單位機關介入所有人民的政治活動。國家公權力在長期戒嚴中受到濫用，人民的基本權利完全失去保障。

根據法務部向立法院所提之一份報告的資料顯示，戒嚴時期，軍事法庭受理的政治案件29,407件，無辜受難者約14萬人。然而，據司法院透露，政治案件約6、7萬件，如以每案平均三人計算，受軍事審判的政治受難人，應當在20萬人以上，他們就是「白色恐怖」的犧牲者。

光是以1950年代的前五年為例，國民黨政府在台灣至少殺害了4000個至5000個，甚至於8000個以上的本省和外省的「匪諜」、知識份子、文化人、工人和農民，並將同樣數目的人判處十年以上有期徒刑到無期徒刑。這就是一般所謂的「台灣五零年代白色恐怖」。一直要到1984年12月，最後兩個五零年代的政治終身監禁犯林書揚與李金木，在坐滿34年又7個月以上的牢後，才釋放出獄。

1991年由於廢除《懲治叛亂條例》，以及1992年《中華民國刑法》第一百條的修正，終結了言論叛亂罪的法律依據，在某種意義上可以視為臺灣白色恐怖的真正結束。

對於「白色恐怖」受難人數，白色恐怖基金會呈報行政院的數據，自1999年起至2007年6月底為止，申請補償的件數為八千五百件，已領補償金者為一萬三千人。白色恐怖基金會執行長倪子修表示，這些只是領取受難補償的人數，並非確切受難人數。