十六世紀以前，臺灣除了有原住民居住之外，也有一些過客，偶爾會到臺灣駐足停留，這些人多屬於來自中國和日本的漁民、商人與海盜。
早期從中國要到臺灣，由於造船技術、航海技術及知識的不發達，要東西橫越台灣海峽的「黑水溝」，是一件危險的事，因此中國人民從閩粵沿海去南洋，或日本長崎的多，來台灣的少。不過，因為澎湖距離中國大陸較近，所以到了十二、十三世紀（約南宋時候）。已有漢人來到澎湖定居並且從事農、漁業生產。到了元朝至正年間（十四世紀中葉），元朝政府設立「澎湖巡檢司」，澎湖被納入中國版圖。明朝後期（約十六世紀末），造船技術與航海技術已經較為發達，才有更多的漢人來到台灣。但都只是零星的漁民，明帝國也未在台灣設官治理，沒有視台灣為其領土的一部分。
早期漢人與台灣的接觸，除了一些零星的漁民之外，要以十六世紀中葉活躍於中國東南沿海，兼具海盜與商人雙重身分的集團為主。這些集團，以林道乾、林鳳、李旦、顏思齊、鄭芝龍等集團的勢力較大。
其中林道乾集團，在 1563 年曾受明朝都督 俞大猷 的追討，一度逃到台灣。據聞林道乾藏匿的據點，是在今天高雄的柴山，傳說當時林道乾為填補船上裂縫，甚至屠殺柴山的打狗社平埔族，以其血作為黏補的工具，後來林道乾離開台灣，還在柴山埋了許多黃金。這些傳說目前仍在南部流傳，至於真假就難以考證了。
林鳳集團也曾因逃避官兵的追迫，率領大批船艦經澎湖、台灣，逃至菲律賓、南洋，他們擁有戰艦多艘、水手上萬人，武裝力量不小。但無論是林道乾或是林鳳，都僅以台灣為其逃亡的過路，而非久居下來。
顏思齊 集團則曾經遭日方緝捕，而約於 1621 年逃亡臺灣，落腳於臺灣的魍港（今布袋港）一帶。顏思齊乃以魍港為中心，鎮撫當地的原住民，分配部下開墾。後來，他的道上弟兄鄭芝龍等人，也從閩南先後帶來了漳州、泉州地方的難民約三十多人，加入顏思齊的陣營。他們以諸羅山（今嘉義）地區為中心從事開發。
1625 年， 顏思齊 病逝，鄭芝龍接管這支勢力。 1628 年，明朝政府有感於鄭芝龍勢力之大，難以消滅，乃採取招撫政策，委派他擔任海防游擊（後來一直升到總督），利用他來取締東南海面的其他小海盜。鄭芝龍一方面以明朝官員身分掃除其他海盜勢力，另一方面與荷蘭人訂立通商條約，鄭芝龍因此得以壟斷中國東南沿海的海上貿易。同一年，鄭芝龍又動員福建飢民數萬人到台灣開闢耕地，據說他每人給銀三兩，牛一隻。
除了中國的海盜外，日本海盜也橫行於中國沿海。明嘉靖年間，日本海盜曾與林道乾集團結黨，攻擊台灣且一度佔領雞籠 ( 基隆 ) 地區。
1593 年 ( 明萬曆 21 年 ) ，日本幕府將軍豐臣秀吉曾遣使到臺灣，招諭「高山國」稱臣納貢，後因秀吉去世而不了了之。
1604 年，有日本人山田長政來到台灣，當時，已有為數不少的日本人進入台灣活動，他們在台或從事採金事業，或從平埔族原住民手中獲取土地開墾。
1609 年，有日本巨商有馬晴信來到台灣，調查台灣的物產、港灣，想要壟斷台灣的貿易，並利用台灣作為對中國貿易的基地。有馬晴信還要求台灣的原住民向日本投降納貢，但遭到原住民的反抗，一行人匆匆逃回日本。
到了 1615 年，日本幕府將軍德川家康想要大舉侵台，於次年命令長崎代官村山等安籌畫侵台事宜。村山等安乃命令次子村山秋安率船艦 13 艘，眾 3 、 4 千人向臺灣進發。船隊航行至琉球時，遭遇到颱風侵襲，僅一艘船順利抵達台灣。抵台之日軍，孤軍登岸深入，結果被台灣原住民所殲滅。
雖然侵台行動失敗，但日本人在台之活動仍十分活躍。至 1636 年，德川幕府實行鎖國政策，日本人早期在台灣的活動才暫告絕跡。
趙慶河教授談十七世紀中國海商集團
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隨著十五、六世紀，西方的地理大發現及新航路的開闢，歐洲進入海權時代。歐洲新興的海權國家，紛紛往東方世界發展。到十七世紀初，東亞海面已形成了葡萄牙以澳門；西班牙以菲律賓的馬尼拉；荷蘭以印尼的巴達維亞 ( 雅加達 ) 為根據地，展開商業競爭。臺灣在地理上剛好處於三個據點的範圍內，因此淪為西方勢力的獵場，乃勢所必然。
 17 世紀葡、西、荷在遠東的三大據點
資料來源：李筱峰繪製
專訪趙慶河教授
首先是西班牙於 1596-1597 年，西班牙駐馬尼拉總督曾三次上書建議西班牙國王佔據台灣。同時在馬尼拉召開攻台軍事會議。 1598 派軍艦 2 艘，兵 200 多人準備攻台，因遇颱風而返。 1626 年才正式進佔北台灣。
接著葡萄牙國王亦曾於 1610 年下令其駐臥亞總督儘早佔領台灣，此計畫因受荷、英之阻而放棄。
荷蘭則曾於 1603 年及 1623 年兩度佔領澎湖，經與明帝國交涉訂約，於 1624 進佔台灣。統治達 38 年。
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荷蘭佔領南臺灣
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轉口貿易的展開 |
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荷、日的貿易衝突
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西班牙佔領北臺灣
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1624 年，荷蘭人捷足先登佔領南台灣，使西班牙在貿易方面感受極大的威脅與不安，西班牙駐馬尼拉總督乃在 1626 年派遣兩艘軍艦，從呂宋出發攻台。因南部早一步為荷蘭所佔，遂沿台灣東岸北上。 首先 抵達今台北福隆附近的東北角，而將之命名為 Santiago ，後來音譯為現在的三貂角。接著進入現在的基隆港，而將港口命名為「至聖三位一體港」。西班牙並於現在基隆的和平島舉行佔領儀式，在島上建築「聖薩爾瓦多城」，正式佔領北台灣。
1628 年以後，西班牙的勢力發展到淡水，在那裡建了一座「聖多明各城」，成為今日淡水紅毛城的前身。西班牙人佔有淡水後，逐步台北盆地及其周邊的原住民部落。 1634 年﹐又試圖將勢力發展到今天的宜蘭平原。但因為那裡的噶瑪蘭原住民強悍，所以西班牙人的勢力一直無法進入蘭陽平原。
 聖薩爾瓦多城
1626 年，西班牙人在社寮島上
舉行佔領儀式並開始築城，命
名為「聖薩爾瓦多城」
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 濱田彌兵衛相關圖片
西班牙人現今基隆港，命名為
「至聖三位一體港」
資料來源：李筱峰、劉峰松
《台灣歷史閱覽》，頁 44 |
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荷蘭與西班牙在臺灣的爭霸
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臺灣自 1620 年代中期起，一南一北被荷蘭、西班牙兩個西方國家先後佔領，這兩個國家，也先後展開 , 歷時十六年的殖民地競爭，雙方衝突迭起，馬尼拉的西班牙當局，以及北台灣的西班牙人，都曾派軍艦攻擊荷蘭人，但都沒有成功；而荷蘭人也屢次揮軍北上，試圖驅逐西班牙人。
由於西班牙佔領的北台灣，在當時來說不是經濟的精華地帶。而當時精華地帶的嘉南平原，乃是在荷蘭人掌握之下。因此，西班牙在北台灣的發展顯然比不上南部的荷蘭人。另一方面，因為明朝的戰亂，使來到雞籠與西班牙人貿易的中國商船不多，而日本又採鎖國政策，厲行禁教，使得西班牙人貿易和傳教事業都不順暢。並且，北台灣的惡劣氣候，讓許多西班牙移民難以適應，許多人紛紛返回馬尼拉去。北台灣的原住民也不斷反抗，動搖西班牙的殖民統治。最後是菲律賓南部的民答那峨的回教民，經常反抗西班牙人的殖民統治，終使馬尼拉的西班牙總督決定改變在台灣的經營，縮小台灣的駐軍。
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西班牙統治下的台北盆地 當時的台北盆地，有不少教堂分布。
資料來源：《先民的足跡》，台北：南天， 1991 年。 |
1635 年，駐在台灣的西班牙軍隊被抽走四分之三的兵力返回菲律賓，僅留守部分軍隊於雞籠一隅，連淡水的聖多明各城也廢棄。 1642 年，荷蘭人再度揮軍北上，將西班牙勢力逐出台灣。
西班牙人被打敗後退出台灣，總計在北台灣統治達 16 年，他們在北部開採硫磺輸出，也輸出鹿皮。除貿易之外，並致力於天主教的傳播。 1631 年，曾經在淡水建立玫瑰聖母堂。到西班牙人退出台灣為止，受洗的原住民達四千多人。
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荷蘭統治下的原住民
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荷蘭進佔台灣的主要區域為嘉南平原，這個範圍正是平埔族西拉雅人的生活範圍。因此荷蘭統治初期，有不少平埔族起身反抗荷蘭統治，但都為荷蘭當局所鎮壓。
荷蘭人征服平埔族原住民後，在平埔族地區設置一種所謂的「地方議會」制度來管理原住民。同時，荷蘭在臺灣的地方行政事務，委由東印度公司所屬的傳教士負責。這些牧師在各土著部落中，進行傳教的工作。當時，在臺灣的荷蘭人是屬於喀爾文教派的「改革派教會」。
為使傳教方便，荷蘭傳教士又用羅馬拼音文字寫成西拉雅族的平埔語的《聖經》及多種宗教書籍。新港社到了 1659 年時，其住民已有 83% 信仰基督教，是當時諸平埔族部落中接受基督教最盛的一個社，這種羅馬拼音的西拉雅語文在新港社也最盛行，故稱此種文書為「新港文書」。這是原住民族歷史上首度出現自己的文字。而新港文在荷蘭人離開後仍繼續被使用，目前被發現的新港文書，年代最晚者在 1813( 清嘉慶 18) 年，距離荷蘭人離開台灣已有一百五十年。
 單語新港文書 資料來源：
周婉窈，《台灣歷史圖說》
台北：中研院台史所， 1997 年 |
 雙語新港文書
平埔族與漢人訂契約時，深恐為漢
人所欺，因而 在契約上加註拉丁文
補充。
資料來源：李筱峰 《台灣史 100 件
大事》，台北：玉山社， 1999 年 |
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荷蘭統治下的漢人
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漢人較大規模移入台灣，大致是從荷蘭時代開始。荷蘭人佔領台灣後，為了發展經濟作物稻米和甘蔗，需要更多的人手種作，因此獎勵中國大陸的漢人來台居住，以便從事稻米和甘蔗的種植。
雖然漢人為荷蘭人利用來從事臺灣的開發生產，然而，荷蘭人也未放棄對漢人進行剝削與壓榨，終使漢人在荷蘭統治台灣的最後十年，爆發了一場大規模抗荷的郭懷一事件。
郭懷一事件最後受到荷蘭當局殘酷的鎮壓。雖然反抗事件終歸失敗，卻也反映了荷蘭在臺灣的統治，已經是搖搖欲墜。
荷蘭統治下的台灣
在圖中可看出往來台灣的貿易船頗為頻繁，捕
鹿是荷蘭時代的重要經濟活動。
資料來源：引自鮑曉鷗，
《 Spaniards in Taiwan 》，台北：南天，2001 年 |
李筱峰老師談赤崁樓與荷蘭統治
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